冲锋舟驾驶员需经过专业培训并取得资质。启动前检查燃油量、发动机状态、船体气密性。登船时按体重均匀分布，保持船体平衡。操作时缓慢加油门，避免急加速造成船头抬起过高。转弯时减速并向内侧倾斜身体。靠岸时低速接近，用桨或手缓冲，避免冲撞造成损坏。
接近被困人员时，从下游方向低速靠近，防止水流将船推撞被困者。到达位置后关闭发动机，用船桨控制位置。将被困者从船头或船侧拉上船，拉人时注意船体重心变化，防止翻船。多人救援时按体重均衡安排座位，上船后立即转移到安全地带。
洪水中航行时注意观察水下障碍物，如电线杆、树木、围墙等。遇到漂浮物提前避让，不要强行冲撞。逆流行驶时走S形路线，利用回流区省力。顺流行驶时控制船速，用船尾先过障碍物。夜间航行开启航行灯，降低速度，谨慎操作。
每次执行任务前检查船体、发动机、救生装备。船上必须配备足够的救生衣、急救包、锚、绳索、手电筒等。操作人员和乘客必须全程穿着救生衣。任务结束后清洗船体，检查有无划伤漏气，发动机排空燃油妥善存放。定期维护保养，确保随时处于待命状态。